У 2014 році, під час початку окупації Криму, він фактично виконував обов’язки командувача українського флоту, але відмовився виконувати накази керівництва держави, порушив військову присягу та перейшов на бік держави-агресора.

Після переходу на службу до РФ у липні 2014 року Єлісєєва призначили заступником командувача балтійського флоту рф. На цій посаді він відповідав за бойову підготовку особового складу. Це був перший випадок, коли вищу командну посаду в російських збройних силах де-факто зайняв колишній український офіцер-зрадник.

Навіть після масштабних кадрових «чисток» у штабі Балтійського флоту РФ у 2016 році, коли звільнили понад 50 адміралів і капітанів, засуджений залишився єдиним вищим офіцером командування, який зберіг свою посаду.

Надалі він демонстративно публічно підтримував державу-агресора, зокрема під час святкування 9 травня носив російську військову форму разом із раніше отриманими українськими державними нагородами, переробленими на російський лад.

Засуджений внесений до санкційних списків України, США, Канади, Великої Британії, Європейського Союзу та інших держав-партнерів.

Його визнано винним у державній зраді, дезертирстві, посяганні на територіальну цілісність і недоторканність України, участі у терористичній організації та веденні агресивних воєнних дій (ч. 1 ст. 111, ч. 1 ст. 408, ч. 3 ст. 110, ч. 2 ст. 28 ч. 1 ст. 258-3, ч. 2 ст. 28 ч. 2 ст. 437 КК України). Він став одним із перших вищих офіцерів українського флоту, щодо якого було розпочато судове переслідування за державну зраду.

Вирок ухвалив Приморський районний суд м. Одеси 8 червня 2026 року за публічного обвинувачення прокурорів Спеціалізованої прокуратури у сфері оборони Південного регіону.